Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNQ2O43526 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNQ2O43526 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms