Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNPO2O14787 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms