Protein–RNA interactions for Protein: L7N2C9

Vmn1r117, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r117L7N2C9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r117L7N2C9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r117L7N2C9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms