Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms