Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC144AA2RUR9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC144AA2RUR9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms