Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CIPCQ9C0C6 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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