Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
GTF3C6Q969F1 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms