Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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