Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CCDC85BQ15834 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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