Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CACNA1SQ13698 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CACNA1SQ13698 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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