Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TOP3AQ13472 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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