Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CLDN34-201ENST00000445307 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL390728.3-201ENST00000452704 270 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AP005329.3-201ENST00000609924 686 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Z99129.4-201ENST00000624649 2435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KCNK2-203ENST00000444842 3379 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AL512662.1-201ENST00000624850 2251 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 MYOCD-201ENST00000343344 2817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KIFAP3-203ENST00000367767 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 ADH4-212ENST00000629236 1974 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CLN3Q13286 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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