Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TRIM28Q13263 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms