Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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TRAF1Q13077 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAF1Q13077 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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