Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTP4A2Q12974 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTP4A2Q12974 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTP4A2Q12974 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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PTP4A2Q12974 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTP4A2Q12974 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTP4A2Q12974 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTP4A2Q12974 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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