Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PTPN13Q12923 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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