Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CALD1Q05682 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms