Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
EPHB4P54760 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms