Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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