Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
PTPRMP28827 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms