Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms