Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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SALL4Q9UJQ4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SALL4Q9UJQ4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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