Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
BHLHE41Q9C0J9 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms