Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
LRRIQ1Q96JM4 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms