Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ZNF548Q8NEK5 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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ZNF548Q8NEK5 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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ZNF548Q8NEK5 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
ZNF548Q8NEK5 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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