Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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