Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GJB6-205ENST00000636852 1840 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
GRIK4Q16099 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms