Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
VPS72Q15906 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms