Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms