Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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BRD3Q15059 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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