Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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CHD4Q14839 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHD4Q14839 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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