Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC01487-201ENST00000462531 905 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SMCO1Q147U7 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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