Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CNGB1Q14028 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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