Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CDH18Q13634 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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CDH18Q13634 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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CDH18Q13634 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CDH18Q13634 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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