Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CUL4BQ13620 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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