Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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FOXE3Q13461 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
FOXE3Q13461 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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