Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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ITGB3BPQ13352 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ITGB3BPQ13352 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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