Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SP140Q13342 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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SP140Q13342 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SP140Q13342 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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