Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXD4Q12950 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms