Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TTPAP49638 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TTPAP49638 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TTPAP49638 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
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