Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP005131.1-201ENST00000585366 4745 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 ANAPC5-208ENST00000535482 2077 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 AOX2P-204ENST00000487742 3284 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
TRHP20396 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 MAPK10-240ENST00000639175 2596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 ADCY10P1-203ENST00000567255 4569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 FBN2-204ENST00000508053 11132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC074286.1-202ENST00000441205 567 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 SIPA1L1-211ENST00000555818 7831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC073349.2-201ENST00000427545 1603 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 POF1B-202ENST00000373145 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRHP20396 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 LRRC37A-202ENST00000393465 4997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 TRIM6-203ENST00000380107 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 CD164-201ENST00000275080 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRHP20396 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms