Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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