Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147 ms