Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CIPCQ9C0C6 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms