Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms