Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR10G4-201ENST00000320891 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SNORA71A-201ENST00000364729 134 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP204-201ENST00000365481 310 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TRBV27-201ENST00000390399 387 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA2-IT1-201ENST00000416770 579 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL450304.1-201ENST00000418657 759 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4F2P-201ENST00000424047 938 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS23P8-201ENST00000429775 330 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC007000.1-201ENST00000453064 794 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL417P-201ENST00000459938 265 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AMD1P3-201ENST00000508874 994 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC092818.1-201ENST00000523411 639 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01588-213ENST00000557142 492 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NUTF2P6-201ENST00000560892 385 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010931.1-201ENST00000565063 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC00969-229ENST00000596584 863 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-229ENST00000599314 739 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NDUFB1-206ENST00000605997 336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC027348.1-201ENST00000615979 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR6124-201ENST00000617177 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 KCNQ1OT1_2.1-201ENST00000619507 196 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RN7SL650P-201ENST00000619902 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ALG13-226ENST00000622986 582 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CU634019.6-201ENST00000623165 710 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL356481.2-201ENST00000629902 528 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms