Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms