Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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SEC23BQ15437 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEC23BQ15437 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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