Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
EXOSC2Q13868 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms