Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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